荔枝根系因苗木繁殖方法不同而异。实生树及嫁接树有发达的主根;高压(圈枝)繁殖的荔枝侧根须根发达,没有主根。荔枝的根系由很多粗壮发达的侧根和纤细茂密的细根所组成,初生的幼根白色,肉质,质脆易断,俗称“豆芽根”。
荔枝树树体高大,百多年生的树高16.0米以上,树冠直径15.0米以上,主干粗大。树皮粗糙成微龟裂状,但较龙眼光滑,灰白色、灰褐色或黑褐色。
土层瘠薄或地下水位高,树冠较小;土层深厚肥沃,树冠较大。驳枝繁殖的植株主干不明显,且多为3~4条主干,成多干型,树冠较开张,成半圆头形;实生植株,主干明显,成单干型,树冠多成圆头形。
由结果母枝抽出的能开花结果的枝条称结果枝。荔枝的花芽是混合芽。当花穗发育过程遇高温时,抽出带叶花序的结果枝;当花穗发育过程遇低温时,抽出不带叶的纯花序,结果枝不明显,变成花序的主轴。
荔枝枝梢的特性因品种而异。禾荔的枝条密而短;大造、水东疏而长;桂味硬而脆。荔枝新梢黄绿色,表皮着生许多灰白色的圆形或椭圆形的斑点;老熟的枝梢灰褐色;多年生枝条颜色较深。
一个小花组一般由三个花蕾组成,品字形排列,二个小花组和中间一个单花蕾即七个花蕾构成一个花组。有些大穗型的花穗还由二个花组和中间一个单花蕾,即15个花蕾组成一个大花组。一般2~7个花组(或大花组)构成一个支穗。
荔枝叶为偶数或奇数羽状复叶,小叶一般2~5对,对生或互生。其中禾荔复叶由1~8片小叶组成,以2~4片小叶较多。荔枝小叶椭圆形或披针形或卵圆形,长5~16厘米,宽2~5厘米,柄短,先端渐尖荔枝树。
荔枝花穗抽出至开花前的孕蕾期长短与多种因素有关,但以冬春(1~3月)的气温影响大,一般为30~40天,而开花期的长短则与品种、气候、花穗抽生早迟等有关,短的仅15天,长的可达86天,荔枝树的开花有如下特性。