内果皮由多个心皮发育而成,发育成熟的心皮称为瓢囊,瓢囊内壁上的细胞发育成菱形或纺锤形半透明晶体状的肉条称为汁胞,汁胞常有纤细的柄;种子甚多或经人工选育成为无籽,种皮平滑或有肋状棱,子叶及胚乳白或绿色,很少乳黄色,单胚或多胚,多胚的其中有一个可能是有性胚,其余为无性胚,种子萌发时子叶不出土。
花瓣通常长1.5厘米以内;雄蕊20-25枚,花柱细长,柱头头状。叶柑橘的叶片为常绿性的单生复叶,由叶身、叶翼组成。叶翼着生在叶柄上。柑橘种类品种不同,叶的大小不等,形状各异。根由主根、侧根、须根及须根端着生极短的根毛构成的群体,统称为根系。压条或繁殖的植株,无主根。树干与根交界处,叫根颈。 [4] 枝干柑橘枝干由主干、主枝、侧枝组成。
果形种,通常扁圆形至近圆球形,果皮甚薄而光滑,或厚而粗糙,淡黄色,朱红色或深红色,甚易或稍易剥离,橘络甚多或较少,呈网状,易分离,通常柔嫩,中心柱大而常空,稀充实,瓢囊7-14瓣,稀较多,囊壁薄或略厚,柔嫩或颇韧。