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分公司办理税务登记的流程如下：
准备材料：
基础材料：
分公司营业执照副本原件及复印件。复印件需清晰且加盖分公司公章，用于证明分公司的合法经营主体资格。
分公司组织机构代码证原件及复印件（部分地区已多证合一，无需单提供）。若需提供，复印件同样要加盖公章以确认组织机构代码信息。
分公司法定代表人（负责人）身份证原件及复印件。确保复印件上的身份证信息清晰可辨，能证明法定代表人的身份真实有效。
经营场所相关材料：
若经营场所为自有房产，需提供房屋所有权证原件及复印件。复印件应显示房产的具体位置、面积等信息，并加盖分公司公章。
如果是租赁房产，要提供租赁合同原件及复印件以及出租方的房屋所有权证复印件或其他合法产权证明文件。租赁合同应明确租赁期限、租金等信息，复印件需加盖分公司公章。
总公司相关材料：
总公司营业执照副本原件及复印件。复印件加盖总公司公章，用于证明总公司的主体资格以及与分公司的关联关系。
总公司税务登记证副本原件及复印件（部分地区已多证合一，无需单提供）。若地区要求提供，需提供加盖总公司公章的复印件，以便税务部门了解总公司的纳税情况。
总公司出具的分支机构负责人任职文件。文件应明确分公司负责人的职责、权限和任期等信息，加盖总公司公章。
其他材料：
财务负责人、办税人员身份证原件及复印件。复印件上的身份信息需清晰可辨，同时需提供财务负责人和办税人员的联系方式等信息 。
若委托代理人办理，需提供授权委托书。委托书应明确委托事项、权限和期限等内容，由分公司法定代表人签字并加盖分公司公章 。
选择办理方式：
线下办理：
携带准备好的材料前往分公司所在地的税务局办税服务厅。
向办税服务厅的工作人员索取《税务登记表》，并按照要求如实填写表格中的各项信息，如分公司的基本信息、经营范围、总公司信息等 。
将填写完整的《税务登记表》及其他相关材料一并提交给办税服务厅的工作人员。工作人员会对提交的材料进行审核，如发现材料不或填写有误，会要求补充或修改。
审核通过后，缴纳税务登记证的工本费（有的地区规定免缴）。
税务机关会在规定的时间内发放税务登记证及副本。
线上办理：
打开电子税务局的网站，部分地区电子税务局有 “新办纳税人套餐” 等功能模块。
按照系统提示进行身份信息报告确认，录入统一社会信用代码、法人身份证号等信息后点击 “进行登记信息确认”。
进入信息填写页面，填写基础信息和其他登记信息。基础信息中带 “” 的必填项需根据营业执照上的信息填写，注意 “总分机构类型” 要选择分支机构，并填写上机构（总公司）信息和下机构（分公司）信息；其他登记信息中带 “” 的也需填写，如投资方名称是总公司的名字，证件种类是营业执照，证件号码是总公司的税号等。
填写完信息后仔细检查确认无误后提交。
根据系统提示上传总公司营业执照、分公司营业执照、分公司法人身份证正反面照片、分公司财务负责人身份证正反面照片、分公司办税人身份证正反面照片等相关材料（具体要求根据当地税务机关而定）。
提交成功后，等待税务机关的审核。审核通过后，可以在电子税务局上查看或下载税务登记证。
后续事项：
税种核定：税务登记完成后，税务机关会根据分公司的经营范围等信息进行税种核定，确定分公司需要缴纳的税种、税率、申报期限等。纳税人应按照核定的税种和期限按时进行纳税申报 。
签订扣税协议：如果分公司需要通过银行账户代扣代缴税款，需要与银行签订扣税协议，并将协议提交给税务机关备案 。
领取发票：根据分公司的经营需要，向税务机关申请领购发票。在申请领购发票时，需要提供相关的资料，如税务登记证、发票领购申请表等 。

分公司办理税务登记通常需要填写以下表格：
《税务登记表（适用单位纳税人）》：
基本信息填写：
“纳税人名称”：填写分公司营业执照上的全称。
“纳税人识别号”：若分公司已取得统一社会信用代码，则填写该代码；若尚未取得，可暂不填写，但后续需补充完善。
“登记注册类型”：根据分公司的企业性质进行选择，如有限责任公司、股份有限公司等分支类型 。
“注册地址”：填写分公司营业执照上核准的经营地址。
“生产经营地址”：填写分公司实际开展生产经营活动的地址，如果与注册地址相同，则填写一致即可。
“法定代表人（负责人）信息”：填写分公司负责人的姓名、身份证号码、联系电话等信息。
总机构信息填写：若分公司有总公司，需填写总公司的相关信息，如总公司名称、纳税人识别号、注册地址、联系电话等 。
核算方式：一般选择 “立核算” 或 “非立核算”，具体根据分公司的实际财务核算情况进行选择。如果分公司有立的财务核算体系，能够立计算盈亏，则选择 “立核算”；如果分公司的财务核算由总公司统一进行，则选择 “非立核算”。
经营范围：按照分公司营业执照上的经营范围进行详细填写。
《财务会计制度及核算软件备案报告书》：
财务会计制度信息：填写分公司所采用的财务会计制度名称，如《企业会计准则》《小企业会计准则》等。
低值易耗品摊销方法：根据分公司的实际情况选择，如一次摊销法、五五摊销法等。
折旧方法：填写分公司固定资产的折旧方法，如直线法、加速折旧法等。
成本核算方法：如品种法、分批法、分步法等，根据分公司的生产经营特点选择合适的成本核算方法。
会计核算软件信息：如果分公司使用会计核算软件进行财务核算，需填写软件的名称、版本号、开发商等信息。
具体的表格填写要求可能因地区而异，建议在办理税务登记前，先向当地税务机关咨询或在税务机关的网站上查询相关信息。

分公司办理税务登记一般不需要缴纳费用，但在特殊情况下可能会有一些相关成本。具体如下：
正常情况：按照国家相关规定，自 2011 年 2 月 1 日起，办理税务登记核发税务登记证时，不再收取工本费。
特殊情况或衍生费用：
刻章费用：办理税务登记后，分公司通常需要刻制公章、财务章等印章，用于办理税务业务及日常经营。刻章费用一般为每个章 30 元左右，不同地区、不同材质的印章价格可能会有所差异。
代理记账费用：如果分公司没有配备的财务人员，需要委托的财务公司代理记账，以便准确进行税务申报等财务工作。代理记账费用每月大概在 300-500 元左右，具体金额会因地区、公司业务复杂程度等因素有所不同。
银行开户费用：办理税务登记后，分公司需要到银行开立基本账户，用于缴纳税款等资金往来。银行开户可能会收取 50-200 元不等的开户费，同时如果购买密码器等安全设备，还需要额外支付费用 。