医疗软器械消毒供应中心所遵循标准如下：
WS/T 508-2016医院医用织物洗涤消毒技术规范
WS 310.1-2016医院消毒供应中心部分：管理规范
WS 310.2-2016医院消毒供应中心二部分：清洗消毒及灭菌技术操作规范
WS 310.3-2016医院消毒供应中心三部分：清洗消毒及灭菌效果监测标准
医疗消毒供应中心基本标准（试行）
医疗消毒供应中心管理规范（试行）
医疗软器械流水线应包含清洗、消毒、干燥、检查、折叠、包装、灭菌、储存、发放，建筑面积不少于2000平方米。应至少设置感染管理、质量与安全管理、工程技术管理、信息管理等职能部门，且人员配备、分区布局、设备设施及管理等方面也有高要求。

在进行软器械的清洗消毒时，不能用含氯消毒剂对其预先浸泡和清洗处理，会使蛋白质凝固在材料表面或使材料改性影响防水效果和减少使用寿命。宜冷水预洗，热水预洗会使颜色在织物上改性固化。主洗温度和高温烘干到75°C后要设定阶梯式降温,每分钟降低4°C,烘干过程中可打冷风以减少织物的皱褶和收缩变形。
因软器械密度较高，所以清洗和烘干的装载量不得大于设备内腔容积60%，避免选用压榨脱水方式以防造成软器械撕裂。软器械不能直接熨斗熨烫,建议垫布熨烫。另清洗和烘干设备选择时要注意内腔设计和材质光滑,避免挂丝损害软器械。