采用气调冷藏集装箱运输具有保鲜效果好、储藏损失少、保鲜期长和对果蔬无任何污染的优点。但由于采用气调设备后，技术要求高，冷藏集装箱价格高，因此使用还不普遍。

有一种低压冷藏集装箱与气调冷藏集装箱类似，这种集装箱是将果蔬置于低压环境中进行储运。箱内压力为1333～10666 Pa，相对湿度90%～95%，温度一2℃～+16℃。氧的含量为（0.1±0.03）%，要进行换气，以便限制乙烯和
等有害气体。低压冷藏集装箱由制冷系统、真空系统和动力系统组成。制冷系统用于降低温度；真空系统用于排除箱中的空气和水汽；动力系统用于柴油发电，供集装箱用电。

冷藏冷冻集装箱箱内的温度升、降速度与箱内装载货物有关，当达到设定温度范围-18℃±3℃后，应维持其箱内温度的稳定。但在计算冷藏箱不制冷时箱内温升时，可采用如下经验公式作为标准值计算
1）冷却货（不通风时）0.0054*(tw-tn）℃/h
2）冷冻货0.0067*（tw-tn) ℃/h
式中tw和tn分别为外界温度和箱内温度℃。

根据冷藏集装箱材质，冷藏集装箱可以分为铝质冷藏集装箱和钢质冷藏集装箱。由于铝质冷藏集装箱的成本比较高，且容易损坏，维修费用高，所以在2000年后逐渐被淘汰，主要生产钢质冷藏集装箱，在SHSCRC（COM）可以看到相关图片。

冷冻货物、一般冷藏货物及危险品等，由于货物自身不会发出热量，而且在装箱前已预冷到设定的运输温度，其堆装方法非常简单，仅需将货物紧密堆装成一个整体即可。在货物外包装之间、货物与箱壁之间不应留有空隙。但所装货物应低于红色装载线，只有这样，冷空气才能均匀地流过货物，货物达到要求的温度。

冷冻集装箱保鲜货物因有呼吸作用而产生二氧化碳、水汽、少量乙烯及其他微量气体和热量。堆装方式应当使冷空气能在包装材料和整个货物之间循环流动，带走因呼吸产生的气体和热量，补充新鲜空气。有以下两种标准装箱方式。