由于无机物离子的直径都很小(0.3~0.7nm),用普通的凝胶型树脂是完全可以除去;但当水中有有机物分子存在时,由于其分子很大(胶硅化合物的粒径可大于50nm,某些蛋白质分子为5~20nm),用普通凝胶树脂除去它们则有困难。而且再生时,这些被吸附的有机物也不易被再生下来,所以凝胶型树脂易于被有机物所污染。
离子交换树脂以这种方式起作用,因为它的官能团基本上是固定的离子,它们地结合在树脂的聚合物基质中。这些带电离子将容易与相反电荷的离子结合,这些离子通过施加抗衡离子溶液而被输送。这些反离子将继续与官能团结合,直至达到平衡。
有机污垢是树脂污垢和降解常见和昂贵的形式。通常,在井水中仅发现低含量的有机物质。然而,地表水可含有数百万分之一的天然和人造有机物质。天然有机物来自腐烂的植被。它们本质上是芳香族和酸性的,并且可以复合重金属,例如铁。这些污染物包括单宁,单宁酸,腐殖酸和富里酸。