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③ 古地理和古大陆再造：以古大陆再造为，综合运用古地磁、生物古地理、沉积和古气候等资料，重视GIS和计算机自动成图等新技术和新方法的开发和应用，通过地球演化突变期沉积作用、地层格架、生物古地理、地球化学等的研究分析，研究大地构造分区和不同大地构造单元之间的相互联系。把古地理研究与地球动力学相结合，探讨地球表层的行为及其与深部作用之间的关系。把古地理研究与盆地分析、岩浆活动、火山作用与地球的深部过程联系起来，重建地史时期地球动力学演化特征，揭示地球的整体演化的某些规律。
④ 古海洋学：研究南海海域的生物化石记录、沉积地球化学记录与高频气候变化，西太平洋—北印度洋表层热传输及其对华南地区气候变化的影响，孟加拉湾古海洋学信号对青藏高原构造隆升的响应。将在15万年以来西太平洋—北印度洋温盐传输体系的变化特征及其对我国西南地区的降雨影响、350万年以来孟加拉湾水域表层水团化学性质和营养度的变化与青藏高原隆升的耦合关系等方向可能取得重要突破。

③ 成矿系统形成保存条件研究
现存矿床是在长期XX作用中形成并保存下来的，传统的矿床学注重了矿床形成条件的研究，而近来发现矿床保存条件的研究具有更重要意义，矿床的保存与成矿后的构造演化、地理地貌条件有密切关系，决定了矿床的资源环境效应和经济效应。本次研究拟基本建立起矿床形成—保存过程的理论基础和研究方法体系。
④ 造山带成矿体系对矿集区的制约研究
开展秦岭、三江等造山带区域成矿环境、成矿流体作用、大规模成矿作用动力学、成矿系统时空结构与矿化富集规律研究，对大型矿集区及矿田、矿床定位预测提供科学依据，建立造山带成矿学理论体系。
（2）岩石圈—软流圈系统的物质及其深部过程研究：
① 岩石圈—软流圈系统的物质结构
应用多学科结合研究的方法，建立华北克拉通、中国东部新生代大陆裂谷带及中生代造山带、三江及青藏造山带的岩石圈组成结构模型。
② 岩石圈—软流圈系统的深部过程及时空框架
集中探讨岩石圈地幔的不均一性，燕山期以来岩石圈减薄机

（1）资源定量评价新理论、新方法与新技术：XX大调查项目“秦岭－松潘地区成矿规律综合研究”，XX大调查项目“西南三江北段成矿规律和找矿方向综合研究”， 胜利石油管理局“临清坳陷东部油气资源综合评价”，国家“十五”重大科技攻关“金属矿产资源快速评价预测系统研究”， 国土资源部“高分辨率光谱遥感信息XX应用研究”,矿区深部矿体定位预测的多源趋势外推法研究等。
（2）非传统矿产资源基础研究：国土资源部“新型矿产资源预测评价”，“基于XX异常理论的区域矿产资源定量预测系统”等。
（3）煤油气XX与洁净化开发利用：国家自然基金及国家973项目“煤层气藏预测理论”。
（4）油气勘探开发新理论与新技术：国家973项目“大型叠合盆地层序地层与构造古地理”，中石化集团公司项目“海相碳酸盐岩油气田勘探评价理论、方法与技术”、“非构造油气藏预测理论、方法和技术”。