采用加热消毒的消毒柜是通过红外发热管通电加热，柜内温度上升至120至170摄氏度，才能达到消毒之目的。而里面的红外线加热器管的电极却是很容易因为潮湿而氧化。如果刷完的碗还滴着水就放进消毒柜，其内部的各个电器元件及金属表面就容易受潮氧化，在红外发热管管座处出现接触电阻，易烧坏管座或其他部件，缩短消毒柜的使用寿命。
消毒柜是可代替普通碗柜，并起到避免洁净碗筷二次污染的保洁作用。但是，虽说消毒碗柜的密封性比较好，但是如果里面的红外管长期不发热，柜子里的潮湿空气难以及时排出，附着在餐具上的霉菌照样会滋生，危害人体健康。因此，把带水的餐具放入消毒柜内又不经常通电，这样会导致电器元件及金属表面受潮氧化，在发热管管座处容易出现接触电阻，易烧坏管座或其他部件，缩短消毒柜的使用寿命。消毒碗柜好一两天通电消毒一次，少也要每周开一两次，这样既起到消毒的目的，又可延长其使用寿命。应将餐具洗净沥干后再放入消毒碗柜内消毒，这样能缩短消毒时间和降低电能消耗。
消毒柜并非是能消灭“千毒万毒”的“神柜”，并不是所有的东西放进去都能够消毒，包括部分餐具在内的东西，都是不适合用消毒柜消毒的。不同类型的餐具应该分别消毒，即将不耐高温的餐具放进低温消毒室消毒，耐高温的可放入高温消毒室。 一般来说，塑料等不耐高温的餐具不能放在下层高温消毒柜内，而应放在上层臭氧消毒的低温消毒柜内消毒，以免损坏餐具。一些花花绿绿的盘子不宜放入消毒柜中消毒。因为这些陶瓷碗碟的釉子、颜料含有铅、镉等重金属，若遇到高温就容易溢出。消毒柜在工作状态下，内部温度可高达200摄氏度。经常在这些消毒过的彩色瓷器里放置食品，容易使食品受到污染，危害健康。碗、碟、杯等餐具应竖直放在层架上，好不要叠放，以便通气和尽快消毒。彩绘器皿尽量不要放入高温消毒柜中消毒，因为其中含有化学物质，在常温下它们呈稳定状态，而在高温下可能会释放有害物质，危害人体健康。
消毒柜应放置在干燥通风处，离墙不宜小于30厘米。消毒期间非必要时，请勿开门，以免影响效果。消毒结束后，如过十分钟再取用的话，效果更好。
消毒过程中除非必需，否则不要打开柜门，既影响消毒效果，又增加耗电量。 如果是高温消毒方式的消毒柜，消毒结束后，柜内温度仍较高，一般要10～20分钟后，方可开柜取物。 每次消毒完毕，都要及时关闭电源，或拔下电源插头。
维修保养：消毒柜应水平放置在周围无杂物的干燥通风处，距墙不宜小于30cm。 要定期对消毒柜进行清洁保养，将柜体下端集水盒中的水倒出并洗净。清洁消毒柜时，先拔下电源插头，用干净的湿布擦拭消毒柜内外表面，禁止用水冲淋消毒柜。若太脏，可先用湿布蘸中性洗涤剂清洗，再用干净的湿布抹净洗涤剂，后用干布擦干水分。清洁时，注意不要撞击加热管或臭氧发生器。
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