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2003年11月11日，《新京报》创刊。
2011年9月2日，经新闻出版总署批准，由光明日报报业集团主管、光明日报报业集团和南方日报报业集团主办的《新京报》从即日起变更为北京市主管主办。
2016年10月17日凌晨一则“京华时报停刊！人员并入北京晨报，新京报则划入北京日报集团。”的消息在网络迅速流传。对此，新京报辟谣称，网传“新京报将并入北京日报集团”，辟谣：绝无此事！新京报日均88个版，周五112个版。《新京报》采用科学的版面分叠方法：分为A /B/C/D四叠，A叠为时政新闻和体育新闻，B叠为财经新闻和产业周刊，C叠为娱乐新闻和文化副刊，D叠为北京生活杂志。在各叠基础上，设置了十二周刊，周一为电视周刊和汽车杂志，周二通信周刊，周三数码周刊，周四食品健康周刊，周五商贸家电周刊、黄金楼市和书评周刊，周六财金周刊、娱乐周刊和赛道周刊，周日地球周刊。在分叠和周刊的框架上，新京报还推出了六大特色栏目，即来论/来信、北京宝贝、北京爱情、北京地理、气象新闻、漫画联盟栏目。